Ninjaþjálfun er fjölbreytt en í leiknum Flip Ninja er hún algjörlega einstök. Hetjan brýtur allar hugmyndir um þyngdarlögmálin og flýgur á milli tveggja palla sem staðsettir eru fyrir ofan og neðan. Verkefni þitt er að gefa honum skipunina um að hoppa til að rekast ekki á það sem flýgur í geimnum.