Ninja verður ekki aðeins að geta barist, líkamleg þjálfun verður einnig að vera upp á sitt besta. Í leiknum Ninja Jump, mun hetjan okkar æfa stökk og þú munt þjálfa náttúrulega viðbrögð þín. Verkefni hetjunnar er að stökkva yfir palla, lengd stökksins fer eftir lengd ýtingar hetjunnar.